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#好久不见#string数据库的使用方法

#好久不见#string数据库的使用方法

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#好久不见#string数据库的使用方法

string数据库是研究网络药理学中蛋白质相互作用的一个常用数据库,操作简单,页面简洁。那么新手如何操作来获取蛋白质相互作用网络图呢?

首先,打开string数据库的页面,选择“Multiple proteins”。

在第一个框中,粘贴蛋白英文名,呈现出每行一个蛋白的格式。或者点击“Browse”选择包含蛋白名称的excel表格进行上传。

粘贴或者上传完毕后,选择“Organism”即输入蛋白的所属物种,可以是人类,大鼠,小鼠等(输入human,rat,mice即可匹配出相对应的专业英语词汇)。如果包含多种蛋白,也可以选择“auto-detect”。点击“search”即可。

若是选择“auto-detect”,则会自动匹配出最合适的物种。点击“continue”即可。

页面会跳转出你输入的蛋白名称以及相匹配的多个蛋白条目。勾选匹配正确的蛋白质,匹配错误的,舍弃即可。继续点击“continue”即可。

最终的呈现图案,可以通过下面多个条目进行更改,若要下载,选择“exports”,并选择400bpi高分辨率的条目即可。